I ett land av öar bestämmer resmålet flygplatsen. Till Bali finns bara en väg in med flyg, Ngurah Rai vid Denpasar, som ligger mitt emellan Kuta, Seminyak, Jimbaran och Nusa Dua. Ön saknar tåg, så förbokad transfer eller app-taxi tar dig vidare, till exempel till Ubud omkring 35 km bort. Huvudstadens Soekarno-Hatta är landets mest trafikerade flygplats och en knutpunkt för inrikesflyg; de flesta internationella avgångarna går från Terminal 3, och ett flygtåg kör in till Jakarta.
Öster om Bali har Lombok sin flygplats vid Praya i söder, med Gili-öarna och vulkanen Rinjani inom räckhåll. Komodo nationalpark nås via Labuan Bajo längst västerut på Flores. Templen Borobudur och Prambanan på Java ligger närmast Yogyakarta International, som sedan den ersatte den gamla stadsflygplatsen ligger omkring 40 km väster om staden. Surabaya på Östra Java är ingången till Mount Bromo och Ijen. På Sumatra har Kualanamu vid Medan eget flygtåg och leder vidare mot Lake Toba och orangutangerna i Bukit Lawang, och dykare på väg till Bunaken landar i Manado på norra Sulawesi.
Svenska medborgare behöver visum, vanligen visum vid ankomst (VoA) eller e-VoA som söks i förväg, och passet ska vara giltigt minst sex månader. Landet har flera tidszoner: Java och Sumatra ligger sex timmar före svensk vintertid, Bali, Lombok och Sulawesi ytterligare en timme före.
